Как мне доказать что его не было и получить выплату за смену категории

Андрей!

Вопросы медицинского обслуживания военнослужащих должны решаться в соответствии с уставами ВС РФ и Положением о порядке прохождения военной службы, утверждённым Указом Президента РФ №1237 от 16.09.99. Командир части должен при необходимости направить военнослужащего на лечение или военно-врачебную комиссию для оказания медицинской помощи или оценки состояния его здоровья и категории годности к военной службе.
Направление военнослужащих на медицинское освидетельствование для определения категории годности к военной службе производится в соответствии с положениями Инструкции об организации направления военнослужащих Вооруженных Сил Российской Федерации, граждан, проходящих военные сборы по линии Вооруженных Сил Российской Федерации, на медицинское освидетельствование, утверждённой Приказом Министра обороны РФ от 15 февраля 2016 г. N 55.
Само освидетельствование проводится в соответствии с Положением о военно-врачебной экспертизе, утверждённым Постановлением Правительства РФ №565 от 4.07.13, категория годности определяется в зависимости от выявленных проблем со здоровьем
Если проблемы со здоровьем есть, а командир уклоняется от направления военнослужащего на ВВК, надо обращаться в военную прокуратуру.

Доказать наличие у Вас указанного заболевания (если ранее ВВК не проводилась и на гепатит тогда Вас не проверяли) можно только медицинскими документами, которые могли быть оформлены Вами при обращении к врачам до заключения контракта. Наличие и отсутствие заболевания, а также ход его развития фиксируются только медицинскими работниками в рамках реализации соответствующих процедур, предусмотренных стандартами диагностики и лечения болезни. Теоретически можно попробовать решить этот вопрос по результатам экспертизы (но это больше вопрос к врачам), которую может назначить суд, если Вы решите добиваться справедливости в суде.