В соответствии со ст. 203 ГПК РФ
Течение срока исковой давности прерывается совершением обязанным лицом действий, свидетельствующих о признании долга.
После перерыва течение срока исковой давности начинается заново; время, истекшее до перерыва, не засчитывается в новый срок.
Т.е. если должник признает наличие долга, например, признательным ответом на претензию, подписанием акта сверки, частичной оплатой суммы долга, то такие действия будут по правилам ст. 203 ГК РФ свидетельствовать о том, что должник с предъявленной задолженностью согласен, и течение срока исковой давности прервется совершением должником действий, подтверждающих признанием им долга.
После совершения указанных действий, если сумма долга не будет еще оплачена в полном размере, течение срока исковой давности начнется заново.
Таким образом, если должник планирует частично оплатить задолженность за пределами срока исковой давности, срок исковой давности для взыскания оставшейся части долга по правилам ст. 203 ГПК РФ начнет течь заново.
Об этом также прямо указано в п. 2 ст. 206 ГК РФ:
Если по истечении срока исковой давности должник или иное обязанное лицо признает в письменной форме свой долг, течение исковой давности начинается заново.
Неблагоприятный сценарий для должника:
Признание им долга, предъявленного за пределами срока исковой давности, в т.ч. путем частичной оплаты задолженности. В этом случае течение срока исковой давности прервется, а после совершения признательных действий срок исковой давности начнется заново.