Подскажите имеет ли оперативный сотрудник во время обыска фотографировать на личный телефон

В данной ситуации это техническое средство используемое в следственном мероприятии. В протоколе СМ должно быть указано на использование такого средства

Во время проведения следственных действий, в частности обыска, следователем (дознавателем) оформляется соответствующий документ, в котором указываются дата, время, место, кто и на основании чего проводит обыск, в отношении кого, указываются лица участвующие при мероприятии и их процессуальный статус, используемые при обыске технические средства (фото, видео, аудио, их марка и модель), результаты обыска, что и где изъято и изъято ли, если изъято то куда направлено, помещено или передано. 

Могут применяется лишь технические средства состоящие на обеспечении ведомства. В случае наличия при обыске событий не указанных в протоколе (присутствие неуказанных в протоколе лиц, применение ими технических средств, производство каких-либо действий и тд) считаются неправомерными и добытые таким путём доказательства могут быть признаны недопустимыми доказательствами и исключены из общей массы доказательств, ну разумеется если об этом заявить соответствующее ходатайство.

В крации всё. 

P.S. При необходимости предоставлю более развёрнутый и аргументированный ответ, со ссылками на закон.