Там всегда будет минималка по этим пособиям или расчет будет идти от дохода самозанятого?

С учётом моего ответа выше далее:

Можно ли в случае больничного по бир, написать 2 заявления на больничный по бир, одно с датой окончания до индексации, а второе после индексации, но с окончанием как по больничному листу.

Прервать отпуск по беременности и родам прямо не запрещено законом.

Но вот повторно оформить вновь  отпуск по беременности и родам по одному и  тому же больничному листку уде будет нельзя, так как  законодательством РФ этого не предусмотрено, следует учитывать данный порядок.

ТК РФ Статья 255. Отпуска по беременности и родам.

Из статьи следует:

Женщинам по их заявлению и на основании выданного в установленном порядке листка нетрудоспособности предоставляются отпуска по беременности и родам...-www.consultant.ru/document/cons_doc_LAW_34683/dee45bc06a23ff585430585ef34c8124f5d89120/

Дополнительно можете ознакомиться здесь: base.garant.ru/58072301/

и здесь:https://www.kdelo.ru/qa/179318-mojet-li-sotrudnitsa-na-nekotoroe-vremya-prervat-otpusk-po-beremennosti-i-m4-2018?pw=558

Далее я продолжу в следующем ответе ниже.

С учётом моих ответов выше далее:

… для пособия по уходу написать отказ от выплаты и отпуска за день до индексации, а через пару дней после индексации заново написать на отпуск и выплату?

Отказаться от пособия закон допускает только в отношении другого лица, которое имеет право осуществлять уходу за ребенком в отпуске по уходу за ним, например отца ребёнка, при этом мать ребёнка также может находиться в отпуске по уходу за ребёнком, но без получения пособия.

Федеральный закон от 29.12.2006 N 255-ФЗ   «Об обязательном социальном страховании на случай временной нетрудоспособности и в связи с материнством»  Статья 11.1. Условия и продолжительность выплаты ежемесячного пособия по уходу за ребенком, можете ознакомиться полностью по следующей ссылке:https://www.consultant.ru/document/cons_doc_LAW_64871/ce727f48032d92e0b9cbf635aad18b2c6c470610/

Из статьи следует:

4. В случае, если уход за ребенком осуществляется одновременно несколькими лицами, право на получение ежемесячного пособия по уходу за ребенком предоставляется одному из указанных лиц.

Если же оформляет одно лиц, то закон в обязательном порядке предусматривает выплату указанного пособия в рамках обязательного социального страхования.

ТК РФ Статья 256. Отпуска по уходу за ребенком.

Из статьи следует:

Порядок и сроки выплаты пособия по обязательному социальному страхованию в период указанного отпуска определяются федеральными законами.-https://www.consultant.ru/document/cons_doc_LAW_6659/25110bf284e89644efcba097c2813f55d0adda0b/#dst53

Федеральный закон от 29.12.2006 N 255-ФЗ   «Об обязательном социальном страховании на случай временной нетрудоспособности и в связи с материнством»  Статья 11.1. Условия и продолжительность выплаты ежемесячного пособия по уходу за ребенком, можете ознакомиться полностью по следующей ссылке:https://www.consultant.ru/document/cons_doc_LAW_64871/ce727f48032d92e0b9cbf635aad18b2c6c470610/

Из статьи следует:

1. Ежемесячное пособие по уходу за ребенком выплачивается застрахованным лицам (матери, отцу,… фактически осуществляющим уход за ребенком и находящимся в отпуске по уходу за ребенком ....со дня предоставления отпуска по уходу за ребенком до достижения ребенком возраста полутора лет.

Если же не брать отпуск по уходу вовсе, то это право, а не обязанность по закону. т.е. работница вправе не использовать отпуск по уходу за ребенком и при этом не будет получать пособие по уходу, и имеет право обратиться за предоставлением указанного отпуска и пособия в любое время до достижения ребёнком возраста 3-х лет, когда посчитает нужным.

ТК РФ Статья 256. Отпуска по уходу за ребенком.

Из статьи следует:

По заявлению женщины ей предоставляется отпуск по уходу за ребенком до достижения им возраста трех лет. 

Далее я продолжу в следующем ответе ниже.