Как можно наказать работодателя?

Здравствуйте! 

Если разделение отпуска  с вами  не согласовывалось, то  Вы вправе  обратился в суд с исковым заявлением и  потребовать отменить разделение ежегодного отпуска на две части путем отмены графика отпусков, а также взыскать с работодателя компенсацию морального вреда. 

ТК РФ Статья 392. Сроки обращения в суд за разрешением индивидуального трудового спора
 
Работник имеет право обратиться в суд за разрешением индивидуального трудового спора в течение трех месяцев со дня, когда он узнал или должен был узнать о нарушении своего права, а по спорам об увольнении — в течение одного месяца со дня вручения ему копии приказа об увольнении либо со дня выдачи трудовой книжки или со дня предоставления работнику в связи с его увольнением сведений о трудовой деятельности (статья 66.1 настоящего Кодекса) у работодателя по последнему месту работы.

При этом,  

При наличии спора о компенсации морального вреда, причиненного работнику вследствие нарушения его трудовых прав, требование о такой компенсации может быть заявлено в суд одновременно с требованием о восстановлении нарушенных трудовых прав либо в течение трех месяцев после вступления в законную силу решения суда, которым эти права были восстановлены полностью или частично.

См. статью по ссылке: www.consultant.ru/document/cons_doc_LAW_34683/eff4cd3e27ee6ffdc716306e3cab5c403c3c2dcb/