Здравствуйте, Ольга!
Насколько я понял речь идет о получения жилищного сертификата выдаваемого для
7) обеспечение нуждающихся в улучшении жилищных условий жилой площадью в размерах и в порядке, которые установлены Правительством Российской Федерации, один раз;
ст.17 Закона N 1244-I
Если ошибся уточните вопрос
В этом случае сертификат выдается исполнительным органом субъекта РФ на территории которого указанные граждане состоят в органе местного самоуправления на учете в качестве нуждающихся в жилых помещения
б) в рамках реализации мероприятия по обеспечению жильем граждан, подвергшихся радиационному воздействию вследствие катастрофы на Чернобыльской АЭС, аварии на производственном объединении «Маяк», и приравненных к ним лиц процессных мероприятий — гражданам, указанным в подпункте «е» пункта 5 настоящих Правил, исполнительным органом субъекта Российской Федерации, на территории которого указанные граждане состоят в органе местного самоуправления на учете в качестве нуждающихся в жилых помещениях, предоставляемых по договорам социального найма;
п.18 Постановления Правительства РФ №153
1. Нужна ли прописка в чистой зоне, для получения данного сертификата?
Нужна не только регистрация по месту жительства (пребывания), но и постановка на очередь, как нуждающейся в улучшении жилищных условий
2. Получить сертификат можно будет только в городе, в который переехала, или по всей области?
Сертификат это социальная выплата, приобрести жилье можно будет на всей территории субъекта, который его выдал.
3. В какую службу обращаться, чтобы встать на учет как нуждающаяся в жилье для получения сертификата?
Обратиться нужно в орган местного самоуправления по месту регистрации.
То-есть в Вашем случае нужно зарегистрироваться и встать на учет в Московской обл.
Ольга, поскольку для получения сертификата нужно встать на учет в качестве нуждающихся в жилых помещениях, то нужно подать заявление в МФЦ или орган МСУ.
Тот факт, что жилье планируется к приобретению в Московской области не имеет значения, если вы состоите на учете в Брянской области. Для оформления сертификата в Московской области нужно встать на учет в Московской области.