Или, оставаясь только прописанной, важно, что она по-прежнему инвалид и пенсионер?

Уважаемая Анна Анатольевна! Если Ваша мама — москвичка, то она не теряет никакие льготы как ветеран труда или инвалид, так как право на льготы для инвалидов установлено федеральным законодательством и не связано с наличием/отсутствием у инвалида недвижимого имущества (кроме налоговый льгот по недвижимости). Льготы ветеранам труда и жилищные субсидии устанавливаются субъектами РФ, но в столице они также не связаны с правом собственности. После выбытия из квартиры второго льготника, конечно, увеличится размер квартплаты, так как льготы по каждому виду коммунальных услуг коррелируются с числом льготников, зарегистрированных в квартире, с площадью жилого помещения, приходящегося на 1 льготника, и общим нормативом площади на одиноко проживающего (не более 33 кв.м в Москве). Размер жилищной субсидии, вероятно, уменьшится. Отдельным параметром являются взносы в Фонд капитального ремонта, которые платят только собственники помещений в МКД. Так как Вы  зарегистрированы по месту жительства не там, где Ваша 1/4 доли, то Вам желательно обратиться на личный прием в Абонентскую службу ФКР (ул.Героев Панфиловцев) для подтверждения права собственности и выяснения, как на Вашу долю теперь будет происходить начисление. Право на санаторно-курортное лечение, материальную помощь, социальную помощь на дому и участие в программе «Московское долголетие» ни от семейного положения женщины-пенсионерки, ни от ее собственности не зависят. Главное в Москве — московская «прописка». По другим регионам страны необходимо обращаться в местные органы социальной защиты населения.