Подскажите пожалуйста, как лучше это сделать?

Здравствуйте) Самый простой вариант это обратиться к нотариусу и составить соглашение о разделе совместно нажитого имущества в соответствии со ст. 38 СК РФ. Заранее продумайте все условия договора, которые будут устраивать Вас обоих и обращайтесь к нотариусу. 

Здравствуйте!

Подойдет вариант с брачным договором. В нем вы можете поменять режим совместной собственности на режим личной собственности, и наоборот — режим личной собственности на режим совместной собственности (ст.42 СК РФ).

Обратитесь к нотариусу.

Наталья, добрый день.

Подскажите пожалуйста, как лучше это сделать? Через обмен, дарение, продажу или другой вариант.

 Приемлемы все варианты.

В качестве альтернативы Вы можете заключить брачный договор, которым определить право собственности только на данные квартиры.

В силу ст. 42 СК РФ

1. Брачным договором супруги вправе установить режим  раздельной собственности на имущество каждого из супругов.

Брачный договор подлежит обязательному нотариальному удостоверению.

На его основании Вы в последующем можете осуществить регистрацию права собственности каждого из Вас на вновь приобретенную недвижимость.

 Для удостоверения брачного договора можно обратиться к любому нотариусу (п. 2 ст. 41 СК РФ; ст. 40 Основ законодательства РФ о нотариате).

Наталья, здравствуйте! 

В вашей ситуации, когда оба супруга имеют в собственности квартиры (одна приобретена в браке на личные средства, другая — до брака), наиболее простым, удобным и юридически корректным способом «обмена» квартирами между супругами является заключение брачного договора.

 В соответствии со статьей 42 СК РФ

Брачным договором супруги вправе изменить установленный законом режим совместной собственности (статья 34 настоящего Кодекса), установить режим совместной, долевой или раздельной собственности на все имущество супругов, на его отдельные виды или на имущество каждого из супругов.

www.consultant.ru/document/cons_doc_LAW_8982/497f052f1260df20dcbb1700e0e71423cf350878/
 Брачный договор позволяет супругам по взаимному согласию определить, какое имущество и в каком режиме (совместная, долевая или раздельная собственность) будет принадлежать каждому из них, в том числе и в отношении уже имеющегося имущества.

Таким образом, Вы можете в брачном договоре прямо указать, что квартира, ранее принадлежавшая одному супругу, становится собственностью другого, и наоборот.

 Оформление брачного договора осуществляется в нотариальной форме, что обеспечивает его юридическую силу и защиту интересов обеих сторон. Нотариус также проверит соответствие условий договора требованиям закона, в частности, чтобы положения договора не ставили одного из супругов в крайне неблагоприятное положение и не противоречили основным началам семейного законодательства.

С уважением, Дарья Алексеевна!