Здравствуйте Анна.
Предположу что финансовое обеспечение закупки было с учетом ст. 78.1 БК РФ.
В бюджетах бюджетной системы Российской Федерации предусматриваются субсидии бюджетным и автономным учреждениям на финансовое обеспечение выполнения ими государственного (муниципального) задания, в том числе в рамках исполнения государственного (муниципального) социального заказа на оказание государственных (муниципальных) услуг в социальной сфере
Данное финансирование идет как финансирование затрат на иные цели.
Субсидия на иные цели может быть предоставлена автономному учреждению в соответствии с абз. 2 п. 1 ст. 78.1 БК РФ, конкретизированным в Постановлении Правительства РФ от 22.02.2020 N 203 «Об общих требованиях к нормативным правовым актам и муниципальным правовым актам, устанавливающим порядок определения объема и условия предоставления бюджетным и автономным учреждениям субсидий на иные цели»
При этом каких-либо требований о проведении закупок в соответствии с Законом N 44-ФЗ при расходовании автономными учреждениями указанных субсидий ПП РФ N 203 не содержит.
Помимо этого, расходы бюджетов бюджетной системы РФ на предоставление государственным (муниципальным) автономным учреждениям субсидий на осуществление капитальных вложений в объекты капитального строительства (строительства, реконструкции, в т.ч. с элементами реставрации, технического перевооружения) государственной (муниципальной) собственности" отражаются по ВР-465. А субсидии из бюджета на иные цели имеют код ВР- 622 в соответствии с Приказом Минфина России от 06.06.2019 N 85н.
Таким образом, применять 44-ФЗ нет необходимости.
Относительно соблюдения 223-ФЗ необходимо лишь соблюсти следующее:
По общему правилу нельзя формировать его таким образом, чтобы это приводило к ограничению числа участников (п. 2 ч. 1, п. 2 ч. 6.1 ст. 3 Закона N 223-ФЗ).
Закупка у единственного поставщика по 223-ФЗ возможна только тогда, когда этот способ закупки будет определен в Положении о закупках заказчика. Для проведения закупки у единственного поставщика по 223-ФЗ при ее сумме свыше 100 тыс. руб. (500 тыс. для отдельных организаций) необходимо опубликовать позицию в плане закупок, подготовить для размещения сведения и документы, разместить их в Единой информационной системе (ЕИС), если это предусмотрено положением.
Чтобы у контрольных органов не возникало вопросов, почему то или иное основание включено в перечень, необходимо пользоваться объективными причинами, например, ограниченностью рынка, когда на нем отсутствуют конкуренты. В ином случае такой перечень будет признан злоупотреблением правом. Большая часть закупок должна проводиться конкурентными способами.
Для более детальной консультации по Вашему случаю необходимо посмотреть документы дела представленные в арбитражный суд и в УФАС.
Отзыв в арбитражном процессе составляется по правилам ст. 131 АПК РФ.
С уважением, Евгений
Этот процессуальный документ называется отзыв на исковое заявление (ст. 131 АПК РФ):
https://www.consultant.ru/document/cons_doc_LAW_37800/c124b6b0d51ecde0c64b51b279caa23e393e2d80/
Если Вы направляли отзыв в ФАС — теперь Вам необходимо его представить арб. суду.
Если это были какие-то возражения требованиям ФАС до подачи иска — и в них сформирована Ваша правовая позиция — оформите их отзывом на иск. заявление (название поменяйте, а в конце по существу требований, допустим — отказать в удовлетворении иска) — после чего представьте суду и сторонам по делу.