У нас в батальне ВШДР, я заместитель командира роты, меня хотят назначить командиром роты, но в ППД я числюсь в

Ситуация, которую вы описываете, затрагивает сразу несколько аспектов военного права и порядка назначения на должности в Вооружённых Силах РФ.

 
1. Назначение на должность
В соответствии с Положением о порядке прохождения военной службы (утв. Указом Президента РФ от 16.09.1999 № 1237) назначение на воинскую должность осуществляется приказом командира (начальника), имеющего на это право.
Если в ППД (пункте постоянной дислокации) вы числитесь в другом полку на должности начальника продовольственной службы (начпрод), а фактически исполняете обязанности в батальоне ВШДР, то для законного назначения командиром роты необходим приказ по личному составу.
Без приказа вы формально остаетесь на старой должности, а исполнение функций командира роты будет временным возложением обязанностей, что тоже оформляется приказом (с указанием срока и основания).
 
2. Материальная ответственность
Материальная ответственность военного наступает:

Либо по прямому закону (например, за ущерб, причинённый при исполнении служебных обязанностей, ст. 28 Федерального закона «О статусе военнослужащих»).
Либо по договору о полной индивидуальной материальной ответственности — но он заключается только в случаях, прямо предусмотренных приказами и инструкциями МО РФ.
Если приказа о закреплении за вами материальных ценностей нет, то вы не несёте полной материальной ответственности как должностное лицо за имущество роты, но можете нести ограниченную (в пределах одного оклада и месячного довольствия) при наличии вины.
 
3. Законность назначения
Фактически назначить вас командиром роты могут только приказом, причём с исключением из списков одной части и зачислением в списки другой.
Если приказа нет — вы формально остаетесь на своей должности в ППД.
Возложить исполнение обязанностей командира роты можно временно, тоже приказом, но в таком случае все вопросы по материальной ответственности (в том числе за вооружение и имущество роты) должны быть отдельно оформлены актами приёма-передачи.
 
4. Что важно сделать
Попросить оформить приказ о назначении или временном исполнении обязанностей, чтобы у вас было письменное подтверждение полномочий.
Если вас хотят сделать материально ответственным лицом — требуйте оформления акта приёма-передачи имущества и приказа.
Если приказа нет, а обязанности требуют исполнения полномочий командира роты — вы формально не отвечаете как командир роты, и это важно при возможных проверках.
 
Если хотите, я могу подготовить для вас письменный рапорт, в котором будет вежливо, но чётко зафиксировано требование оформить ваше назначение или временное исполнение обязанностей официально. Это позволит вам избежать необоснованной ответственности.

Хотите, составлю?