Если иностранец зарегистрируется самостоятельно через приложение АМИНА по моему адресу и иногда будет ночевать там и подтверждать геолокацию, мне как собственнику будут начислять налог?

Здравствуйте! Рассмотрим ситуацию более подробно.

 
1. Регистрация иностранца по вашему адресу через приложение (например, АМИНА)
Если иностранец самостоятельно зарегистрируется по вашему адресу (при этом вы собственник жилья), это официально будет считаться миграционной регистрацией по месту пребывания.

 
2. Будут ли вам как собственнику начислять налог с такой регистрации?
В России налог на имущество собственник платит независимо от того, кто зарегистрирован по адресу (зарегистрированные жильцы на налог не влияют).
Регистрация жильца не увеличивает налог на имущество и не приводит к дополнительным налогам для собственника.
Однако:

Если речь про налог на доходы физических лиц (НДФЛ) или другие налоги — эти налоги оплачивает конкретный иностранец, а не собственник квартиры.
Если квартира сдается внаём, налоговые обязательства появляются у собственника как у арендатора/сдающего в аренду. Простая регистрация постороннего лица без договора найма не создаёт обязанности по уплате налогов на доходы.
 
3. Возможные нюансы и риски
Если иностранец будет проживать у вас длительно, с ним могут связать право пользования или аренды — в некоторых случаях это может повлечь проверку, но само по себе не является основанием для начисления налога собственнику.
Жилищное законодательство и миграционные правила требуют, чтобы регистрация проживающих по адресу была законной и согласованной с собственником (обычно собственник не запрещает регистрацию, если не против).
 
4. Подтверждение геолокации и ночёвки
Это, скорее, связано с доказательством фактического проживания, но не влияет на налоговые обязательства собственника.