Находясь в армии хотят завести уголовное дело угон авто

Добрый день.

Это не препятствует возбуждению уголовного дела.

То есть, если вы находитесь на срочной службе, следователь следственного комитета вправе возбудить уголовное дело.

УПК РФ Статья 151. Подследственность
2. Предварительное следствие производится:

в) о преступлениях, совершенных должностными лицами Следственного комитета Российской Федерации, органов федеральной службы безопасности, Службы внешней разведки Российской Федерации, Федеральной службы охраны Российской Федерации, органов внутренних дел Российской Федерации, учреждений и органов уголовно-исполнительной системы, таможенных органов Российской Федерации, сотрудниками органов принудительного исполнения Российской Федерации, военнослужащими, 

После это свяжутся с вашим командованиям. Потом начнутся следственные действия.