Добрый день, Наталья.
Выделение долей в квартире, приобретенной с использованием материнского капитала, действительно возможно даже при наличии ипотеки, однако процедура имеет ряд особенностей.
1. Материнский капитал предполагает обязательное оформление долей в праве собственности на всех членов семьи (супругов и детей), поскольку использование государственных средств накладывает обязанность обеспечить доли каждого члена семьи, указанного в сертификате.
2. Поскольку квартира находится в залоге у банка (ипотека), любые изменения в правах собственности возможны только с согласия кредитной организации. Это значит, что перед оформлением долей необходимо согласовать данное решение с банком-кредитором.
3. Если ипотека была оформлена на мужа, и жена не выступает созаемщиком, выделение долей также потребует обязательного участия нотариуса, поскольку такая сделка должна быть удостоверена нотариально согласно законодательству РФ.
Обращение в суд необязательно, если всё остальное проходит безукоризненно.