Кто в данном заявление будет выступать ответчиком?

Здравствуйте.

Все верно, если дочь наследодателя была прописана в квартире, то она признается принявшей наследство фактически.

Опровергнуть эту презумпцию можно только в судебном порядке, путем подачи иска об установлении факта непринятия наследства.

Ответчиком будет выступать субъект, в чью собственность переходит соответствующее имущество при признании его выморочным. (п. 2 ст. 1151 ГК РФ)

2. В порядке наследования по закону в собственность городского или сельского поселения, муниципального района (в части межселенных территорий) либо муниципального, городского округа переходит следующее выморочное имущество, находящееся на соответствующей территории:

жилое помещение;

В данном случае это муниципальное образование в лице администрации.

Иск подается в районный суд по месту нахождения ответчика (администрации). Если это Москва, то ДГИ (департамент государственного имущества).

А также кредитор-залогодержатель (банк).

Здравствуйте.Верно сказали, опровергнуть факт принятия наследства можно только через суд.

Кто в данном заявление будет выступать ответчиком? В какой суд подавать? Какие документы нужно предоставить в суд вместе с исковым заявление, чтобы подтвердить факт непринятия наследства?

Ответчиком будет лицо, к кому перешло вымороченное имущество. Ст. 1151 ГК РФ

2. В порядке наследования по закону в собственность городского или сельского поселения, муниципального района (в части межселенных территорий) либо муниципального, городского округа переходит следующее выморочное имущество, находящееся на соответствующей территории:

жилое помещение;

Иск по мету нахождения Ответчика, т.е. администрация. Иск должен соответствовать ст. ст. 131-132 ГПК РФ в любом случае. В Вашем случае это должны быть доказательства, подтверждвющие тот факт, что наследство не принято.

Здравствуйте.

Вы в интересах дочери задаёте вопрос?

Если так, тогда дочь может подать исковое заявление в суд об установлении факта непринятия наследства, как верно и указал нотариус.

Кто в данном заявление будет выступать ответчиком? 

Если в составе наследства только эта квартира, тогда ответчиком будет администрация города, потому что квартира (доля) переходит в собственность муниципалитета.

Если есть ещё какое-то имущество не недвижимое, например, вклады денежные, движимое имущество, тогда ответчиком будет ещё и государство в лице Росимущества.

Заявление исковое, не особое производство.

Апелляционное определение Нижегородского областного суда от 22.05.2018 по делу N 33-5908/2018

… С.С., С.В. обратились в суд с заявлением о признании их не принявшими наследство после смерти сына С.Е…
Установление данного факта необходимо для правильного разрешения спора относительно долгов С.Е.
… в порядке особого производства рассматриваются дела, по которым право заявителя бесспорно, но отсутствие надлежащего закрепления значимых для осуществления данного права обстоятельств препятствует реализации прав лица. Если при подаче заявления или рассмотрении дела будет выявлено наличие материально-правового спора, то его рассмотрение должно происходить по иным процессуальным правилам — правилам искового производства.
… оставляя без рассмотрения заявление С.С., С.В., судья правильно сослался на ст. 263 ГПК РФ, поскольку… в данном случае установление факта непринятия наследства в порядке особого производства недопустимо, поскольку установление данного факта повлечет изменение круга наследников имущества умершего С.Е. и тем самым затронет права других наследников, а в случае их отсутствия — государства как распорядителя выморочного имущества в лице уполномоченных органов государственной власти, а также кредиторов наследодателя.
Вопрос о том, несут ли заявители ответственность по долгам умершего сына С.Е., подлежит разрешению в исковом порядке по требованиям соответствующих кредиторов и не может быть преодолен посредством установления юридического факта в порядке особого производства..."

В какой суд подавать?

Это Московская область, Администрация г. Пушкино. 

В Пушкинский городской суд Московской области.

К рассмотрению дела привлекайте всех известных кредиторов.

Какие документы нужно предоставить в суд вместе с исковым заявление, чтобы подтвердить факт непринятия наследства?

Любые, которые подтвердят, что дочь там не проживала. Потому что определяющим является именно совместное проживание с наследодателем.

Сама по себе регистрация не означает, что дочь там проживала, просто считается, пока не доказано иное, что гражданин проживает там, где зарегистрирован (презумпция, но опровержимая).