У мня проблема с трудовым договором, нет в базе данных работаю 5лет

Здравствуйте. 

Вы гражданка Кыргызстана. Это принципиально важно, потому что граждане Кыргызстана относятся к странам ЕАЭС, а для них в России действует особый, упрощённый порядок работы и пребывания.

Патент вам не нужен.
Отсутствие патента — не нарушение для граждан Кыргызстана.
Проблема не в вас, а в работодателе.

1. Работа 5 лет и «нет в базе»

С большой вероятностью речь идёт не о Пенсионном фонде, а о том, что:

работодатель не подал уведомление в МВД о вашем приёме на работу, либо подал его с ошибками.

По закону именно работодатель обязан: уведомить МВД о заключении трудового договора с иностранным гражданином, сделать это в установленный срок. Если этого не сделано — это его нарушение, а не ваше.
Раз вы реально работали 5 лет, у вас есть фактические трудовые отношения (ст. 16 ТК РФ), даже если работодатель что-то не передал в электронные базы.

2. Трудовой договор и уведомление на руках

То, что сейчас у вас на руках: трудовой договор, уведомление от работодателя,  — это хорошо. Эти документы подтверждают, что вы работаете законно. Даже если данные «не бьются» в базах — это не лишает договор силы.

3. Госуслуги «просят патент»

Портал Госуслуг работает по шаблону и часто некорректно требует патент у граждан ЕАЭС. Это техническая ошибка системы, а не требование закона.

Для граждан Кыргызстана: основание пребывания — трудовой договор, плюс уведомление МВД от работодателя, плюс действующая регистрация.

Вам необходимо:

1. Работодатель

Нужно письменно (лучше через заявление): уточнить, подавал ли он уведомление в МВД о вашем приёме, если не подавал — обязан подать сейчас. Это его прямая обязанность по миграционному законодательству.

2. Продление регистрации

С трудовым договором и уведомлением МВД вы: идёте в МФЦ или миграционный отдел МВД, подаёте документы на продление регистрации как гражданка ЕАЭС.

3. Если работодатель уклоняется

тянет время, говорит «мы всё отправили», но доказательств нет,

у вас есть право: обратиться в трудовую инспекцию, обратиться в прокуратуру.

Ответственность в этом случае несёт работодатель, а не вы.

что не нужно делать

 не оформлять патент — он вам не нужен
 не писать в МВД, что вы «работали без патента»
 не признавать несуществующее нарушение

Вы не нарушитель.
Ваш статус законный.
Проблему создал работодатель, не выполнив свои обязанности.