Добрый вечер.
Поскольку у вас двое несовершеннолетних детей, то расторжение брака — только в судебном порядке, независимо от согласия супруги. Участие в СВО само по себе не меняет порядок расторжения брака, но может повлиять на сроки рассмотрения дела. Но Вы можете ходатайствовать (направить в суд) заявление о рассмотрении дела в ваше отсутствие (ч.5 ст.167 ГПК РФ)
" И в течение какого времени после оплаты пошлины я могу завершить этот развод?" -не совсем понятно про какую пошлину вы указываете- про гос.пошлину в суд при подаче заявления в суд о расторжении брака?
После оплаты госпошлины и подачи искового заявления, вы можете ожидать завершения развода через месяц после вступления решения суда в законную силу, при условии отсутствия апелляций и оперативного рассмотрения дела судом.