Уважаемый Константин, здравствуйте!
То есть каждая из квартир — Ваша личная собственность, не собственность супругов, верно?
Самый простой и юридически чистый вариант — бывшая жена продаёт Вам свою однокомнатную квартиру по обычному договору купли-продажи, регистрируется переход права собственности в Росреестре.
После регистрации Вы становитесь собственником однушки, а затем регистрируете в ней себя и детей по месту жительства.
Это нормальная схема, закон её не запрещает.
Место жительства несовершеннолетнего ребёнка определяется местом жительства его родителей, усыновителей или опекунов.
Прямо это указано в статье 20 ГК РФ:
Местом жительства несовершеннолетних, не достигших четырнадцати лет, или граждан, находящихся под опекой, признается место жительства их законных представителей — родителей, усыновителей или опекунов.
www.consultant.ru/document/cons_doc_LAW_5142/3a21dde6a73d049e1bf187dbd08ecf79ce5e80e2/
Поэтому ребёнка можно зарегистрировать вместе с Вами как с отцом, особенно когда Вы сами будете зарегистрированы в этой квартире.
Согласие второго родителя на регистрацию ребёнка обычно не требуется, как показывает последняя практика)
По сделке с однокомнатной квартирой лучше идти через нотариуса.
По статье 55 Основ законодательства Российской Федерации о нотариате, утверждённых ВС РФ 11.02.1993 № 4462-1, нотариус при удостоверении договора отчуждения недвижимости проверяет принадлежность квартиры продавцу, ограничения, обременения и иные обстоятельства, мешающие сделке.
www.consultant.ru/document/cons_doc_LAW_1581/44f8341bc19a8fbfd5c15befdcb37ea625756d09/
После удостоверения договора нотариус сам направляет документы на регистрацию перехода права в Росреестр в электронной форме. Это быстрее и безопаснее.
В Вашей ситуации я бы рекомендовала такой порядок: сначала оформить куплю-продажу однокомнатной квартиры от бывшей жены на Вас, зарегистрировать Ваше право собственности в ЕГРН, затем зарегистрироваться в этой квартире самому и зарегистрировать там детей.
После этого уже спокойно заниматься продажей трёхкомнатной квартиры другим покупателям.
ВАЖНО!
Сама по себе «прописка» не делает Вас собственником.
Собственником Вы станете только после сделки и государственной регистрации права.
Это следует из статьи 8.1 ГК РФ - права на недвижимое имущество подлежат государственной регистрации и возникают с момента внесения записи в ЕГРН.
www.consultant.ru/document/cons_doc_LAW_5142/0357f6ec88e3d6d7616956dbeb6b6a07e2b393dd/
Также учитывайте интерес несовершеннолетнего ребёнка.
При продаже трёхкомнатной квартиры покупатели почти наверняка будут проверять, кто зарегистрирован в квартире, есть ли среди зарегистрированных дети и куда они выбывают.
Поэтому заранее зарегистрировать Вас и детей в однокомнатной квартире действительно разумно: это снимет основной риск для покупателей и упростит сделку по продаже трёшки.
Т.е., бывшая жена продаёт Вам однушку, нотариус удостоверяет договор и направляет документы в Росреестр, Вы становитесь собственником, затем регистрируете себя и детей в этой квартире.
После этого трёхкомнатную квартиру можно выводить на продажу без лишних вопросов
С уважением, Дарья
Что касается несовершеннолетнего ребенка, то его прописать в однокомнатной можно будет, только если там будет зарегистрирован кто-то из родителей.