Алиса, здравствуйте!
Нет, данные электронной системы пропусков сами по себе не являются автоматическим основанием для оплаты сверхурочной работы. Они подтверждают время входа и выхода, но не доказывают, что всё это время Вы выполняли трудовые обязанности.
Согласно статье 99 ТК РФ сверхурочной считается работа:
за пределами установленной продолжительности смены;
выполняемая по инициативе работодателя — по приказу, поручению, просьбе либо с ведома и одобрения руководителя.
Если Вы приходите раньше по собственной инициативе, например переодеться или подготовиться, а после смены задерживаетесь по личным причинам, это время не признаётся сверхурочной работой.
Иной вывод возможен, если работодатель требует приходить заранее, проводить обязательную передачу смены до её официального начала, продолжать работу после смены, заканчивать отчёты либо выполнять другие задания. Письменный приказ желателен, но его отсутствие не исключает оплату, если фактическое поручение работодателя можно доказать.
Сведения проходной в таком случае будут одним из доказательств наряду с:
рабочей перепиской и поручениями руководителя;
журналами передачи смен;
отчётами и временем операций в рабочих программах;
табелями, видеозаписями и показаниями коллег;
регулярностью ранних приходов и поздних уходов, известной руководству.
Работодатель обязан вести точный учёт фактически отработанного времени. Для взыскания оплаты лучше письменно сообщать руководителю, что конкретная работа выполняется за пределами смены, и просить оформить и оплатить её. Также можно запросить табель и сведения пропускной системы за нужный период.
Если работодатель откажет, спор можно передать в государственную инспекцию труда или суд. Срок обращения в суд по требованиям о невыплаченной заработной плате — один год со дня установленного срока выплаты.
Если пришлёте мне в личный чат на Правовед график, табель, данные проходной и переписку с руководителем, я могу оценить доказательства, рассчитать переработку и подготовить требование работодателю.