Здравствуйте Светлана!
В соответствии с п. 34 ст. 217 НК РФ не подлежат налогообложению (освобождаются от налогообложения) следующие виды доходов физических лиц доходы, полученные налогоплательщиками при реализации дополнительных мер поддержки семей, имеющих детей, в случаях и в порядке, предусмотренных Федеральным законом от 29 декабря 2006 года N 256-ФЗ «О дополнительных мерах государственной поддержки семей, имеющих детей» и принятыми в соответствии с ним законами субъектов Российской Федерации, муниципальными правовыми актами.
Указанным законом установлено право на получение средств федерального бюджета, передаваемые в бюджет Пенсионного фонда Российской Федерации на реализацию дополнительных мер государственной поддержки- материнского (семейный) капитала.
То есть, средства материнского капитала не облагаются налогом Поэтому при получении маткапитала и покупке жилья с его помощью, Вы не уплачивали налог на доходы физических лиц.
Таким образом, действия налогового органа являются правомерными.
С уважением Ф, Тамара