Здравствуйте!
В соответствии с пп. 19 п. 2 ст. 346.43 НК РФ, ПСН облагается:
9) сдача в аренду (наем) жилых и нежилых помещений, дач, земельных участков, принадлежащих индивидуальному предпринимателю на праве собственности;
Согласно ст. 346.47 НК РФ,
Объектом налогообложения признается потенциально возможный к получению годовой доход индивидуального предпринимателя по соответствующему виду предпринимательской деятельности, установленный законом субъекта Российской Федерации.
Следуя п. 19 приложения к закону Республики Башкортостан от 29 октября 2012 г. N 592-з «О патентной системе налогообложения в Республике Башкортостан»,
при сдаче внаем собственного нежилого недвижимого имущества, объект — 1 млн. р.
В соответствие с п. 5 ст. 3 этого закона,
5. По видам предпринимательской деятельности, указанным в подпунктах 19, 45 — 47 приложения, размеры потенциально возможного к получению индивидуальным предпринимателем годового дохода устанавливаются на единицу обособленных объектов и увеличиваются кратно численности таких объектов.
То есть налоговая база увеличивается кратно количеству обособленных объектов.
Под обособленным объектом Минфин понимает тот объект, который определен договором аренды (Письмо от 1 марта 2013 г. N 03-11-10/6075). Из этого и исходят налоговики.Хотя, на мой взгляд, обособленный объект — это объект определенный по данным БТИ, а не его часть, переданная в аренду.
У Вас два договора, поэтому ИФНС соответственно и умножает. Можно сделать один договор аренды, а второй арендатор получит часть у первого в субаренду, тогда налог будет «однократным».