Алексей, здравствуйте, в принципе, подобные изменения вполне могут быть, и так чаще всего и случается при строительстве домов. Бывает и так, что при постановке на кадастровый учет дома, изменяется даже его номер.
Номер квартиры мог измениться из-за того, что в ходе строительства в проект были внесены изменения, например, две квартиры были объединены в одну. Подобные изменения как раз и фиксируются при проведении тех.инвентаризации и постановке дома на кадастровый учет. Кроме того, также незначительно в построенном и поставленном на кадастровый учет объекте от проектной может отличаться и площадь квартиры.
Здесь самое важное, чтобы квартира была именно той, которая описана в договоре, именно для этого в нем прописываются оси, ряды и проектная площадь.
Поэтому, что касается площади, то, например, если она изменилась в меньшую сторону после постановки на кадастровый учет и тех.инвентаризации, то Вам следует обговорить с компанией-застройщиком об уменьшении стоимости квартиры, согласно количеству кв. метров, и бывает обратный момент — когда площадь немного увеличивается и покупателю приходится доплачивать за лишние метры, если иное не оговорено в договоре долевого участия.
В акте приеме-передачи квартиры, который Вам выдадут для регистрации права собственности, должен быть указан номер по результатам инвентаризации и ссылка на номер квартиры по договору.
Расторгать договор в Вашем случае я повода не вижу, так как описанная Вами ситуация стандартна для многих участников долевого строительства и, как правило, ее решение никаких сложностей у собственников не вызывает.