Получение имущественного вычета

Здравствуйте! Мы с супругой приобрели в 2013 году по договору купли-продажи квартиру в общую долевую собственность с распределением долей 1/2. В 2014 году заключили брачный договор и все имущество перевели в общую совместную собственность для того, чтобы один из нас мог полностью воспользоваться имущественным вычетом. На основании брачного договора в 2015 году мы получили новые свидетельства о гос. регистрации права. Собрав все необходимые документы и написав заявление на получение вычета от работодателя, заявление супруги об установлении своей доли в вычете 0%, мы получили отказ от налоговой инспекции в получении полного вычета. Налоговая инспекция аргументировала это тем, что первичным документом для использования данного права является договор купли-продажи. Так ли это на самом деле?