Детальный порядок отражения в бухгалтерском учете операций, связанных с возмещением суммы среднего заработка на время прохождения военных сборов и суммы начисленных страховых взносов, действующими нормативными правовыми актами не определен. При таких обстоятельствах этот порядок может быть разработан бюджетным учреждением самостоятельно и утвержден в составе учетной политики по согласованию с учредителем. Применяемая организацией схема корреспонденций должна учитывать требования Инструкции по применению Единого плана счетов бухгалтерского учета, утвержденной приказом Минфина России от 01.12.2010 N 157н, и Инструкции по применению Плана счетов бухгалтерского учета бюджетных учреждений, утвержденной приказом Минфина России от 16.12.2010 N 174н.
В соответствии со ст. 170 ТК РФ государственный орган, который привлек работника к исполнению государственных обязанностей, выплачивает работнику за время исполнения этих обязанностей компенсацию. Иными словами, данные выплаты относятся к обязательствам государственного органа, а не бюджетного учреждения.
Таким образом, начисление среднего заработка и страховых взносов в рассматриваемой ситуации не должно отражаться по дебету счета 401 20 или 109 00 — соответствующие суммы могут быть учтены в качестве увеличения дебиторской задолженности Военного комиссариата, например, на счете 210 05.