Здравствуйте, Елена!
Понятия «выплаты за преданность» компании в трудовом законодательстве нет. Это выплата установлена вашим работодателем в своих локальных нормативных актах.
Таким образом, чтобы ответить на вопрос нужен текст этого документа. Кроме того, может сформироваться еще своя внутренняя практика по применению этих правил при расчете выплат с учетом декретного отпуска.
В Интернете вижу положение, вероятно, о котором идет речь http://www.rzd.ru/forum/public.... Если оно актуально, то согласно п. 11 в непрерывную продолжительность работы для выплаты вознаграждения за преданность компании не включается время перерыва в работе в случае нахождении в отпуске по уходу за ребенком, предоставляемом женщинам до достижения ребенком возраста трех лет.