Анастасия, добрый день.
Не совсем понятно, что вы имеете ввиду под словом «декрет». Декрет — отпуск по беременности и родам, который наступает и рассчитывается на основании листка нетрудоспособности, выдаваемого на 30 неделе беременности. Если таковой Вам уже выдан, то продолжать работать, по крайней мере официально, Вы не можете, т.к. фактически находитесь на больничном. Если больничный Вам не выдан, то в декрет Вы пока уйти не можете.
В любом случае, отпускные, которые Вы боитесь потерять, Вы можете недополучить только за тот период, который будет недоработан. Здесь нужно смотреть, за какой именно промежуток начисляются отпускные. Если у Вас отработан полностью весь период, за который Вам предоставлен отпуск, то Вы ничего не потеряете.
Кроме того, отпуск Вы вправе взять как до выхода в декрет, так и после.