Уважаемый Василий,
УФМС рассматривает каждый случай таких ошибок в отдельности. Однако согласно приказу ФМС России от 15 октября 2012 года № 320 (пункт 106),
в случае выявления технического брака, несоответствия персональных данных заявителя, внесенных в паспорт, данным, указанным им в заявлении, наличия неустановленных либо внесенных ненадлежащим образом отметок и записей на момент выдачи паспорта, оформляется новый паспорт без повторного представления гражданином документов, предусмотренных Административным регламентом. В этом случае государственная пошлина за оформление паспорта не взимается. При этом максимальный срок изготовления нового паспорта составляет два часа с момента предоставления заявителем фотографии.
Таким образом, если заявление о выдаче паспорта, которое заполняли вы, составлено без ошибок, в т.ч. отчество, то здесь на лицо ошибка техники ФМС, либо человеческий фактор. Гос. пошлина повторно не оплачивается.