Как правильно выбрать способ проведения закупки по выбору перевозчика?

Вы не нарушаете требования №44-ФЗ, если электронный аукцион проводится в соответствии с ч. 2 ст. 59 №44-ФЗ.

Осуществление регулярных перевозок по регулируемым тарифам обеспечивается посредством заключения уполномоченным органом исполнительной власти субъекта Российской Федерации или уполномоченным органом местного самоуправления либо иным государственным или муниципальным заказчиком государственных или муниципальных контрактов в порядке, установленном законодательством Российской Федерации о контрактной системе в сфере закупок товаров, работ, услуг для обеспечения государственных и муниципальных нужд, с учетом положений настоящего Федерального закона (п. 2 ст. 14 №220-ФЗ).

Здравствуйте, Екатерина!

Заказчик во всех случаях осуществляет закупку путем проведения открытого конкурса, за исключением случаев, предусмотренных статьями 56, 57, 59, 72, 83, 84 и 93 Федерального закона 44-ФЗ.

В соответствии с частью 3 статьи 59 44-ФЗ:

Заказчик имеет право осуществлять путем проведения электронного аукциона закупки товаров, работ, услуг, не включенных в указанные в части 2 настоящей статьи перечни.

Поскольку ОКПД2 49.31.21 выведен из перечня закупок, которые Заказчик обязан проводить в электронной форме, у Заказчика в любом случае остается право на проведение такого аукциона.

Таким образом, воспользовавшись правом на проведение аукциона, вы не нарушите закон.