Правомерно ли обложение налогом выплаты по соглашению сторон?

Добрый день. Да, будет, налогообложению подлежит любой доход работника, включая премии, компенсации за неиспользованные отпуска и любые выплаты при увольнении. Соответственно работодатель при выдаче итогового расчета обязан произвести удержание подоходного налога, поскольку он является налоговым агентом и отвечает за удержание НДФЛ и перечисление его в бюджет, официально произведенная выплата возможна лишь за минусом удержаний.