Можно ли брать отпечатки пальцев в 9 лет?

Доброго времени суток, Наталья! 

В соответствии с п. ж, ч. 1, ст. 9 Федерального закона «О государственной дактилоскопической регистрации в Российской Федерации», 

граждане Российской Федерации, иностранные граждане и лица без гражданства: подозреваемые в совершении преступления, обвиняемые в совершении преступления, осужденные за совершение преступления, подвергнутые административному аресту; совершившие административное правонарушение, если установить их личность иным способом невозможно.

Из описанного Вами, следует сделать вывод, что на сегодняшний день единственной процессуальной фигурой из перечисленных выше может быть подозреваемый. 

Согласно ст. 46 УПК РФ

Подозреваемым является лицо:

1) либо в отношении которого возбуждено уголовное дело по основаниям и в порядке, которые установлены главой 20 УПК РФ;

2) либо которое задержано в соответствии со статьями 91 и 92 настоящего Кодекса;

3) либо к которому применена мера пресечения до предъявления обвинения в соответствии со статьей 100 настоящего Кодекса;

4) либо которое уведомлено о подозрении в совершении преступления в порядке, установленном статьей 223.1 настоящего Кодекса.

Таким обращом, если Ваша дочь на сегодняшний день не является субъектом, которым в принудительном порядке может быть произведена дактилоскопия (см. первую ссылку на закон), а в 9 лет такое невозможно, Вы имеете право отказаться от ее прохождения. 

С уважением и удачи!