Как обязать владельца подстанции заплатить за все годы аренды нашей земли?

ЗДравствуйте, Анастасия

В судебном порядке можете решить данный вопрос, если не получается в добровольном порядке 

Статья 304 ГК РФ. Защита прав собственника от нарушений, не связанных с лишением владения (действующая редакция)

Гражданский кодекс РФ Глава 20 Статья 304
Собственник может требовать устранения всяких нарушений его права, хотя бы эти нарушения и не были соединены с лишением владения.

С Уважением 

Здравствуйте, Анастасия! Право требовать возмещения убытков Вам дают ст. 57, 57.1 ЗК РФ:

Возмещению в полном объеме, в том числе упущенная выгода, подлежат убытки, причиненные:

2) ухудшением качества земель в результате деятельности других лиц;

4) ограничением прав собственников земельных участков, землепользователей, землевладельцев и арендаторов земельных участков;

4.1) ограничением прав собственников расположенных на земельных участках зданий, сооружений, помещений в них, лиц, с которыми заключены договоры социального найма или договоры найма жилых помещений государственного или муниципального жилищного фонда в многоквартирных домах, в связи с установлением, изменением зон с особыми условиями использования территорий, режим которых не допускает размещение данных объектов.

Для расчёта убытков имеется методика.

Сначала Вам нужно предъявить претензию владельцу подстанции с требованием возмещения убытков. В случае отказа можно обращаться в суд.