Что делать, если обвиняют в краже на предприятии?

Здравствуйте. 

В рамках уголовного судопроизводства Вы не обязаны доказывать свою невиновность. Бремя доказывания обвинения и опровержения доводов, приводимых в защиту подозреваемого или обвиняемого, лежит на стороне обвинения. (ст. 14 УК РФ).

Таким образом, если возбуждено уголовное дело, то органы следствия обязаны не только документально подтвердить Ваш у виновность, но и проверить все Ваши доводы о непричастности к совершению преступления.

Возможное наказание будет зависеть от квалификации преступления, то есть, по сути, от способа совершения хищения.

Здравствуйте, Таня, согласно УПК Вы не обязаны доказывать свою невиновность

«Уголовно-процессуальный кодекс Российской Федерации» от 18.12.2001 N 174-ФЗ (ред. от 12.11.2018)

УПК РФ Статья 14. Презумпция невиновности
 

1. Обвиняемый считается невиновным, пока его виновность в совершении преступления не будет доказана в предусмотренном настоящим Кодексом порядке и установлена вступившим в законную силу приговором суда.

2. Подозреваемый или обвиняемый не обязан доказывать свою невиновность. Бремя доказывания обвинения и опровержения доводов, приводимых в защиту подозреваемого или обвиняемого, лежит на стороне обвинения.

3. Все сомнения в виновности обвиняемого, которые не могут быть устранены в порядке, установленном настоящим Кодексом, толкуются в пользу обвиняемого.
4. Обвинительный приговор не может быть основан на предположениях.

Миллион рублей — особо крупный размер кражи. 

Полагаю, 

УК РФ Статья 158. Кража

4. Кража, совершенная:
а) организованной группой;

б) в особо крупном размере, — наказывается лишением свободы на срок до десяти лет со штрафом в размере до одного миллиона рублей или в размере заработной платы или иного дохода осужденного за период до пяти лет либо без такового и с ограничением свободы на срок до двух лет либо без такового.