Как получить заработанные деньги, если организация не соблюдает договоренности с работниками?

Здравствуйте. Можете обратиться в инспекцию по труду или в суд.  Если в суд, то там соки согласно ст. 392 ТК РФ

За разрешением индивидуального трудового спора о невыплате или неполной выплате заработной платы и других выплат, причитающихся работнику, он имеет право обратиться в суд в течение одного года со дня установленного срока выплаты указанных сумм, в том числе в случае невыплаты или неполной выплаты заработной платы и других выплат, причитающихся работнику при увольнении.

Конечно надо будет в принципе доказать, что данная «серая» ЗП имеет место быть вообще, придётся приложить некоторые усилия, собраться также доказательства, пригласить может быть свидетелей. Но обратиться вполне можно.