Как быть, если пропал протокол обыска в данном случае?

Добрый вечер. Протокол обыска могли восстановить из материала, который ранее предоставлялся по этому уголовному делу в суд для узаконивания обыска, а также может быть из других материалов этого дела, например продления стражи, получение детализации итд. 

Протокол обыска, т.е., его исходник может быть только один и он должен быть в уголовном деле. Восстановлен постановлением , это от лукавого. Остальное, то что находиться, например, в стражных материалах, это конечно же копии. С копии, даже надлежаще заверенной, невозможно сделать, не говоря о оригинале, даже равноценную, поскольку копии, по правилам делопроизводства  делаются  только с оригинала, Итог, если пропал, по каким то чудесным причинам, сам протокол обыска, на стадии судебного следствия этот правовой изъян, не восстановить, поскольку суд принимает решение на основе имеющихся доказательств в деле а не участвует в их собирании, это дело обвинения, либо защиты. Возвращение дела обратно прокурору, законом нее предусмотрено, поскольку это будет направлено, исключительно, на восполнение неполноты следственных действий. Думаю именно поэтому, дело не ушло дальше суда.