Смогу ли я уволиться, если нахожусь в служебной командировке?

Здравствуйте Андрей.

Часть 1 ст. 80 ТК РФ устанавливает, что работник имеет право расторгнуть трудовой договор, предупредив об этом работодателя в письменной форме не позднее чем за две недели.

Соответственно Вы должно просто уведомить работодателя об увольнении, а не отрабатывать 14 дней.