Добрый день, Татьяна!
Все можно сделать, как Вы хотите. Главное корректно это все оформить. Чтобы на втором предприятии она работала не по совместительству, а как по основному месту работы, ей надо уволиться с первого предприятия. Пусть пишет заявление об увольнении по собственному желанию (с первого предприятия). Если разногласий с работником по срокам увольнения нет, уже на следующий день (при большом желании можно и в тот же день) Вы можете ее уволить.
По соглашению между работником и работодателем трудовой договор может быть расторгнут и до истечения срока предупреждения об увольнении.
Все, на следующий после дня увольнения работа на втором предприятии для нее совместительством уже не будет. Соответственно, Вы заключаете доп соглашение к трудовому договору (по второму предприятию) и меняете в этом трудовом договоре пункты, касающиеся совместительства. Указываете что работа в такой-то должности является для нее основным местом работы.
Также из второго трудового договора можно убрать пункты о работе на 0,5 ставки. Если до момента выхода в отпуск по беременности и родам останется несколько рабочих дней, то ей надо либо отработать их. Либо, если она хочет работать на условиях неполного рабочего времени, ей надо написать на эти дни заявление на отпуск по уходу за ребенком и одновременно заявление о работе на условиях неполного рабочего времени.
По заявлению женщины или лиц, указанных в части второй настоящей статьи, во время нахождения в отпусках по уходу за ребенком они могут работать на условиях неполного рабочего времени или на дому с сохранением права на получение пособия по государственному социальному страхованию.
С ФСС в таком случае никаких проблем быть не должно. Все будет законно.
С уважением!