Что я должна сделать со своей стороны?

Здравствуйте, Дарья! Налоговое законодательство не допускает совмещение двух налоговых режимов. Так как вы направили уведомление о прекращении применения УСН с нарушением срока, то ваша регистрация в качестве ИП аннулируется ( ч.5 ст. 15 ФЗ от 27.11.2018 фз-422). Соответственно налоги, страховые взносы и т.  Д как ИП не нужно 

Здравствуйте, Дарья.

Физическое лицо, действительно, обязано в течение одного месяца со дня постановки на учет в качестве налогоплательщика НПД направить в налоговый орган по месту жительства (по месту ведения предпринимательской деятельности) уведомление о прекращении применения УСН. В этом случае налогоплательщик считается прекратившим применение УСН со дня постановки на учет в качестве налогоплательщика НПД (ч. 4 ст. 15 Закона N 422-ФЗ). 

Если данное уведомление не было направлено или направлено с нарушением срока, то постановка данного лица на учет в качестве налогоплательщика НПД аннулируется (ч. 5 ст. 15 Закона N 422-ФЗ). 

Так что с этим ничего поделать нельзя, налоговый орган поступил правомерно. 

1. Есть ли какая-то возможность просить налоговую считать меня плательщиком НПД, а не УСН за весь аннулированный период с учетом того, что весь этот период я платила НПД в точно таком же размере как платила бы по УСН — 6%. А также освободить от необходимости подавать декларацию и платить взносы в ПФР и ОМС, что соответствует деятельности в качестве самозанятого. 

Дарья

такой возможности нет. То, что 

в налоговой мне не сообщили, что необходимо отказаться от УСН в течение месяца

Дарья

к сожалению, Вам не поможет, так как «знание закона предполагается». Раз уж занимаетесь предпринимательством, считается, что должны знать, как закон регулирует вашу деятельность.

 2. Если это невозможно, какую мне нужно подавать декларацию — «нулевую» или нужно пересчитать весь доход за аннулированный период плательщика НПД и внести его в декларацию?

Дарья

Декларацию нужно подать в порядке, который предусмотрен для УСН и доход придется учесть именно по этому режиму. 

 3. Что делать с уплаченным мной НПД за срок с 28.04.2020 по 20.04.2021? Мне его вернут? Пересчитают в счет налога по УСН после подачи декларации? Что я должна сделать со своей стороны? 

Дарья

Вы вправе согласно ст.78 НК РФ подать заявление о зачете уплаченных сумм по НПД в счет налога по УСН (с 01.10.2020 отменено ограничение по зачету переплаты только в счет налога соответствующего уровня бюджета).

Буду рада пошаговой инструкции.

Дарья

это Вам нужно обратиться к практикующему специалисту по налогам или бухгалтерии. На этом сайте есть подобные специалисты, но стоимость консультации, вероятно будет в разы выше стоимости Вашего вопроса.