Здравствуйте,
ФЗ «О дополнительных мерах государственной поддержки семей, имеющих детей» от 29.12.2006 N 256-ФЗ не содержит запрета на приобретение недвижимости у близких родственников на средства маткапитала. В письме Минэкономразвития от 22.09.2010 № д23-3764 также говорится о том, что ограничений в приобретении жилья у родителей, бабушек или иных родственников на средства материнского капитала быть не может, тем более, когда после покупки доли вся квартира переходит в Вашу собственность. Поэтому отказа ПФ РФ не будет, либо он маловероятен.
Но так как Вы приобретаете долю, то договор купли-продажи должен быть нотариально удостоверен(ст.42 ФЗ 218).
Поэтому, сначала обращаетесь к натариусу для составления договора купли-продажи, сейчас натариусы также и в Росреестр документы направляют сами электронно. Затем, после регистрации сделки документы предоставляете в ПФ РФ. Также для ПФ РФ потребуется нотариальное обязательство о выделении долей детям. После получения денежных средств, распределяете доли и подаете документы в Росреестр.
Проконсультируйтесь с нотариусом, возможно покупку доли нотариус оформит сразу на Вас троих в долях.
Вы понимаете правильно, но Росреестр не зарегистрирует переход права от продавца-отца на Вас, если договор купли-продажи доли не будет нотариально удостоверен. Поэтому сначала надо идти к нотариусу, затем в Росреестр, затем в ПФР, и если перечисление маткапитала продавцу будет произведено, то необходимо будет выделять доли в праве собственности детям на основании ст. 10 Федерального закона от 29.12.2006 N 256-ФЗ «О дополнительных мерах государственной поддержки семей, имеющих детей»