Законны ли их действия и почему не учитывается длительная потеря трудоспособности?

Лилия здравствуйте. 

С ваших слов сложно дать обоснованный ответ, необходимо ознакомиться с заключением эксперта, что бы посмотреть на чем он основывался. 

При указанных вами обстоятельствах должна как минимум быть возбуждена ст.115 УК РФ. Возможно эксперт и дознаватель являются заинтересованными лицами. 

Тут имеет смысл обратить внимание на причинно-следственную связь между конкретными побоями и заключением эксперта. 

Допускаю, что бы вынести решение об отказе в возбуждении уголовного дела, дознаватель указал не все полученные травмы, а лишь самые незначительные из них, а эксперт дал им оценку, о том, что они не несут вреда здоровья. 

Такие действия однозначно незаконны, и препятствуют вам в дальнейшем обратиться за возмещением материального и морального ущерба. 

Если Вы желаете получить более подробную юридическую консультацию по вашему вопросу, либо оформить документы по обжалованию незаконного решения дознавателя, то можете обращаться в чат (кнопка чата находится под сообщением) за получением персональной консультации. По правилам сайта услуги в чате производятся на платной основе