Я в лице главы поселения провела вырубку растительности на муниципальном кладбище, возбудили дело, ущерб посчитали в 50 кратном размере, почему

Надо смотреть к какой земле относится кладбище.  и были ли вами оформлены надлежащие бумаги. 

50 красный размер это высчитывается десятками, на основании постановления правительства РФ. 

Если вы глава администрации и земли ваши, администрации,  то тут спорный вопрос о правомернгсти ваших действий. 

В общем,  без изучения протокола и расчетов сложно что-то сказать однозначно.