Как нашу договоренность правильно оформить, убрать ипотеку из договора?

Здравствуйте, Лада.

Вы и продавец можете заключить дополнительное соглашение к договору купли-продажи, предметом которого является урегулирование спора по поводу выявленных Вами недостатков. В соответствии со ст.475 ГК РФ

1. Если недостатки товара не были оговорены продавцом, покупатель, которому передан товар ненадлежащего качества, вправе по своему выбору потребовать от продавца:

 
соразмерного уменьшения покупной цены;

 
безвозмездного устранения недостатков товара в разумный срок;

 
возмещения своих расходов на устранение недостатков товара.

Выделенное Вы и реализуете в соглашении, кроме того, указываете, что поскольку цена по договору после ее уменьшения уже Вами выплачена, то залог (ипотека) прекращается исполнением обеспеченного залогом обязательства (пп.1 п.1 ст.352 ГК РФ).

Поскольку договор купли-продажи заключался в нотариальной форме, то и доп.соглашения к нему также должны быть нотариальными (п.1 ст.452 ГК РФ).

Заявление о погашении рег.записи об ипотеке в Росреестр подает нотариус.