Добрый день.
я. Вопрос 1: Нужно ли мне подписывать акт-приема-передачи, какие риски?
Вы не обязаны этого делать, поскольку отказываетесь от принятия товара.
В силу ст. 484 ГК РФ
1. Покупатель обязан принять переданный ему товар, за исключением случаев, когда он вправе потребовать замены товара или отказаться от исполнения договора купли-продажи.
2. Если иное не предусмотрено законом, иными правовыми актами или договором купли-продажи, покупатель обязан совершить действия, которые в соответствии с обычно предъявляемыми требованиями необходимы с его стороны для обеспечения передачи и получения соответствующего товара.
Однако, у Вас имеет место ситуация поставки Вам товара ненадлежащего качества, что дает Вам право на отказ от договора, а следовательно на отказ от его приемки и подписания акта.
Вопрос 2: Кто будет оплачивать транспортные расходы (сумма около 10000р только в одну сторону), не удержат ли их?
Оплата в данном случае должна лежать на продавце.
Связано это с тем, что поскольку Вам передали двигатель не отвечающий условиям договора, то речь идет о продаже товара ненадлежащего качества, поскольку согласно ст. 4 Закона РФ «О защите прав потребителей»
1. Продавец (исполнитель) обязан передать потребителю товар (выполнить работу, оказать услугу), качество которого соответствует договору.
А следовательно, по смыслу ст. 18 Закона РФ «О защите прав потребителей» Вы вправе отказаться от товара, данной же статьей предусмотрено, что
7. Доставка крупногабаритного товара и товара весом более пяти килограммов для ремонта, уценки, замены и (или) возврат их потребителю осуществляются силами и за счет продавца (изготовителя, уполномоченной организации или уполномоченного индивидуального предпринимателя, импортера). В случае неисполнения данной обязанности, а также при отсутствии продавца (изготовителя, уполномоченной организации или уполномоченного индивидуального предпринимателя, импортера) в месте нахождения потребителя доставка и (или) возврат указанных товаров могут осуществляться потребителем.
Таким образом, Вы вправе отказаться и от оплаты мотивируя тем, что расходы лежат на продавце.
А какое отношение акт выполненных работ имеет к акту приема-передачи товара по договору купли-продажи?
Опечатался, имелся ввиду акт приема-передачи