Правомерно ли с их сторону взыскивать с меня деньги?

Если образовательная организация сама не исполняла обязательства по договору обучения, то взыскивать с Вас неправомерно. Надо изучать договор на обучение, чтобы понять обязанности ВУЗа и в случае неисполнения ВУЗом обязанностей по обучению можно попытаться расторгнуть договор в судебном порядке (п.п.1) п.2 ст.450 ГК РФ.

Опять же, если ВУЗ несмотря на вашу неуспеваемость переводил Вас на следующие курсы, то это можно квалифицировать как вину кредитора (п.1 ст.404 ГК РФ) и уменьшить в судебном порядке размер платы за учебу