В договоре купли-продажи авто допущена ошибка в цвете кузова, поставят ли на учёт авто в ГИБДД

Могут и не заметить. 

но лучше исправить эту неточность, Так как договор купли-продажи служить правовым обоснованием передачи конкретного автомобиля от одного лица к другому. Понятия «ошибки» в юридической практике РФ нет, поэтому следует руководствоваться общим смысловым значением. Ошибки и исправления недопустимы. 

Что можно сделать:

1. Можно составить новый договор, уничтожив предыдущий.

2. Написать дополнительное соглашение, в котором будет отражено исправление. Дополнительное соглашение можно заключить только в отношении действующего основного договора. Если договор купли-продажи станет недействительным, то и дополнительное соглашение потеряет силу. Дополнительный документ должны подписать обе стороны основной договорённости.  Вспомогательная бумага должна иметь название «дополнительное соглашение к договору номер….» Дополнительное соглашение должно иметь все признаки стандартного договора и содержать в себе информацию о предмете договора, стороны, обязанностях и, конечно, оплошности, которая подлежит исправлению.