Здравствуйте!
После раздела участка на три новых участка прежний участок перестает существовать, и срок владения начинается заново (ст.11.4 ЗК РФ). Поэтому при продаже до истечения 5 лет после даты регистрации нового участка возникает обязанность по налогу (п.4 ст.217.1 НК РФ).
Для уменьшения размера налога вы можете ко всей сумме дохода применить имущественный налоговый вычет (1.000.000 рублей) и заплатить налог с суммы сверх налогового вычета.
Обратите внимание, что при продаже по цене менее 70% кадастровой стоимости применяются правила ст.214.10 НК, то есть доход становится равным 70%.
Нет, вычет применяется в целом в налоговом периоде, т.е. 1 млн. на 3 участка в Вашем случае (ну либо 1 или 2 — в зависимости от размера налоговой базы)