Составили протокол по 12.26 в другом городе, суд был по месту прописки, права сдал в тот отдел ГАИ который составил протокол, будет ли теперь проблемой вернуть права по истечению срока лишения

Александр, добрый день.

В постановлении суда было указано подразделение ГИБДД в которые Вы должны были сдать ВУ?

Сам порядок возврата определен в Правилах возврата ВУ утвержденых Постановлением Правительства РФ от 14.11.2014 N 1191«Об утверждении Правил возврата водительского удостоверения после утраты оснований прекращения действия права на управление транспортными средствами»

Ключевым для Вас является:

2. Изъятое водительское удостоверение возвращается… по истечении срока лишения этого права успешно прошедшему в подразделении Государственной инспекции безопасности дорожного движения Министерства внутренних дел Российской Федерации (далее — подразделение Госавтоинспекции) по месту исполнения постановления суда по делу об административном правонарушении проверку знания им правил дорожного движения ...

То есть экзамен Вам надлежит сдавать по месту где находится административный материал, то есть в регионе где было производство.

И закрывать АМ Вам надлежит там же.

будет ли теперь проблемой вернуть права по истечению срока лишения

Каких либо проблем в целом это не создает, за исключением того, что экзамен Вы сдаете по месту лишения и там же забираете свое ВУ.