В марте ушла на больничный, пришла подменяя в аптеку и нашла какие то онлайн заказы, на номер сменщицы

Здравствуйте, Вера!

Работаю в аптеке с 11.2022 года, 01.02.2024 была переведена в другую, без инвентаризации,

 Допустим, что Вы были переведены на другую работу в соответствии с трудовым законодательством, согласно ст. 72.1 ТК РФ:

 Перевод на другую работу — постоянное или временное изменение трудовой функции работника и (или) структурного подразделения, в котором работает работник (если структурное подразделение было указано в трудовом договоре), при продолжении работы у того же работодателя, а также перевод на работу в другую местность вместе с работодателем. 

без инвентаризации,

 Был ли заключен договор о полной материальной ответственности. Если был, то при переводе на другую работу, инвентаризацию должны были провести.

как приступила к работе много чего не находила, сообщала об этом заведующей, она ничего не предпринимала, были неоднократные скандалы со сменщицей по этому поводу, с меня вычитали недостачу ни за что.

На новой месте работы материальная ответственность может наступить при заключении договора о полной материальной ответственности (или коллективной), а также в случаях, предусмотренных статьей 243 ТКРФ.

с меня вычитали недостачу ни за что

 Ущерб должен быть установлен по фактическим потерям, в соответствии со ст. 246 ТК РФ:

Размер ущерба, причиненного работодателю при утрате и порче имущества, определяется по фактическим потерям, исчисляемым исходя из рыночных цен, действующих в данной местности на день причинения ущерба, но не ниже стоимости имущества по данным бухгалтерского учета с учетом степени износа этого имущества.

Вы должны были дать письменное объяснение — это обязательно!

Если таких объяснений с Вас не требовали, следует дать их самой, в которых с ущербом не соглашаться, требовать доказательства Вашей вины. Если материальные средства Вам не передавались под отчет, то в худшем случае, могут взыскать  в размере среднего месячного заработка.

Ст. 241 ТК РФ:

За причиненный ущерб работник несет материальную ответственность в пределах своего среднего месячного заработка, если иное не предусмотрено настоящим Кодексом или иными федеральными законами.

Взысканные суммы в нарушение закона, оспорить в суде. Могу в этом помочь. Обращайтесь ко мне в личный чат https://pravoved.ru/lawyer/1213967/. Учлуга оплачивается 

После этого была проведена инвентаризация, вышла большая сумма, сейчас я нахожусь на временном отстранении, компания требует возместить убытки, которые наворовала она.

 Вас отстранили на основании чего?

Под основания, предусмотренные ст. 76 ТК РФ Ваш случай не подходит.

Следовательно, и этот факт надо оспаривать, ведь в период отстранения ЗП не выплачивается.

Ст. 76 ТК РФ:

В период отстранения от работы (недопущения к работе) заработная плата работнику не начисляется, за исключением случаев, предусмотренных настоящим Кодексом или иными федеральными законами. 

Подскажите как мне быть?

 При детальном изучении всех обстоятельств дела, думаю, смогу Вам помочь оспорить действия работодателя в суде.

Кроме того, если Вы считаете себя невиновной в ущербе, можете заявить в полицию о  хищении.