Теперь меня официально не трудоустроят получается?

Нет, это не обязательно. Даже во время стажировки беременную женщину нельзя увольнять или отказать в заключении трудового договора по мотивам беременности. Напротив, трудовой кодекс гарантирует беременным защиту от увольнения и дискриминации, в том числе и в период стажировки.  
Что делать в такой ситуации:
1. Не сообщайте о беременности работодателю сразу:
Закон не обязывает беременную женщину сообщать о своей беременности работодателю. Вы можете не говорить о беременности до тех пор, пока не будете готовы.  
2. Подготовьте документы:
В случае возникновения проблем, например, если работодатель попытается уволить вас, вам понадобятся документы, подтверждающие вашу стажировку и выполняемые обязанности.  
3. Обратитесь к работодателю с просьбой о заключении трудового договора:
Напишите официальное письмо с просьбой заключить трудовой договор задним числом, с момента начала стажировки.  
4. Обратитесь в инспекцию труда:
Если работодатель отказывается заключить договор, обратитесь в трудовую инспекцию для защиты ваших прав.  
5. Если потребуется, подайте иск в суд:
Вы можете подать иск в суд с требованием о признании гражданско-правовых отношений трудовыми, а также о возмещении утраченного заработка и морального вреда.  
Важно понимать, что трудовое законодательство защищает беременных женщин от неправомерных действий работодателя. В случае отказа в трудоустройстве или увольнения вы можете обратиться за защитой своих прав в органы государственной власти и в суд.