Куда можно обратиться в такой ситуации, так как считаю это несправедливым

Добрый день, Анастасия.

В случае неправомерного отказа в предоставлении скидки ( ваш случай)  можно подать в отказавшую организацию заявление на письменное разъяснение причин отказа. После получения разъяснения на руки можно подать жалобу в вышестоящие органы. 
Несколько вариантов, куда можно обратиться:
Фонд пенсионного и социального страхования.
НКО для инвалидов.
 
Но вероятнее всего вам и там откажут, поэтому лучше сразу можно обратиться за защитой прав в следующие инстанции:
Прокуратуру. Достаточно написать письменное или устное заявление. На основании заявления проведут проверку. Если факты нарушения прав подтвердятся, виновного привлекут к ответственности.
Суд. Обратиться в суд можно параллельно с жалобой в прокуратуру или в случае несогласия с результатами прокурорской проверки. При обращении в суд придётся самостоятельно собрать и представить доказательства.
Общество защиты прав инвалидов. Такие организации оказывают консультационную и правовую работу с инвалидами.

Добрый день, Анастасия. Напишите жалобу в министерство образование я Вашего субъекта, где подробно изложите обстоятельства разговора с директором, а также сошлитесь на пункты договора, предоставляющие льготы, приложите документ, подтверждающий инвалидность, в любом случае закон на Вашей стороне, условия договора необходимо соблюдать. 
Если мой ответ Вам помог, Вы можете отблагодарить меня небольшой суммой через мой профиль m.pravoved.ru/pay/lawyer-reward/id/3311159/ прямо сейчас. Вам несложно-мне приятно.

 Что можно сделать прямо сейчас, какие доказательства собрать и дам готовый текст письменной претензии в учреждение.

Кратко о позиции и основаниях

• Если условие о скидке прямо содержится в вашем договоре — это обязательство для организации. Они не вправе произвольно отказывать или вводить задним числом какие‑то квоты, если это не согласовано в договоре.

• Если «Положение» ограничивает скидки до 20% учащихся, но это положение не было включено в ваш договор и/или вы не были с ним надлежащим образом уведомлены, организация не может ссылаться на него как на основание отказа.

• Дополнительно — отказать по дискриминационному признаку (инвалидность) также неправильно; можно привлечь органы образования и защиты прав.

Что нужно собрать (доказательства)

• Копию договора (вся страница(ы) с пунктом о скидке).

• Квитанции/чеки/выписки об оплатах за занятия.

• Документ, подтверждающий инвалидность одного из родителей.

• Вся переписка с директором/организацией (e‑mail, сообщения в мессенджерах, скриншоты). Запишите дату и содержание устных разговоров, ФИО собеседников.

• Текст «Положения», на которое ссылаются (если вам его показывали) и любые объявления (например, распечатки/скриншоты о новой скидке/правилах).

• Свидетельства других родителей (если кто‑то из родителей получил скидку — их письменные подтверждения).

Шаги действия (рекомендуемая последовательность)

1) Направить письменную претензию (рекомендую — в двух экземплярах: один оставить у себя с отметкой о вручении или отправить заказным письмом с уведомлением о вручении). В претензии требовать применения скидки и возврата переплаченных сумм/зачёта на будущие платежи. Дать срок для ответа (обычно 10 календарных дней). Ниже шаблон.  

2) Если в срок ответа нет или он неудовлетворителен — обратиться с жалобой в местный отдел образования (администрация, управления образованием) — образовательные учреждения подчиняются местным органам. Приложите копии договора и претензии.  

3) Параллельно направить жалобу в Роспотребнадзор (как в органы защиты прав потребителей) — это обычный путь при спорах с платными услугами.  

4) Если есть признаки дискриминации (по инвалидности) — можно обратиться к уполномоченному по правам человека/детей в регионе или в прокуратуру с заявлением о проверке.  

5) Если и это не решит — иск в суд о защите прав потребителя (требование о выполнении условий договора, взыскание разницы/возврата средств и возмещение морального вреда). Обычно это исковое производство; в простых суммах — исковое заявление в мировой суд.

Полезные практические рекомендации

• Действуйте письменно и официально — устные жалобы легче игнорируются.

• Если у заведующей/директора есть «кто раньше принес — тому и скидка», это подтверждайте письменно (перепиской или свидетелями).

• Объединитесь с другими родителями — коллективная жалоба эффективнее.

• Сохраняйте копии всех документов и отправлений.

Шаблон претензии (скопируйте и заполните)

(В шапке укажите реквизиты организации: название, адрес, ФИО директора)  

От: ФИО родителя, адрес, телефон, e‑mail  

Ребёнок: ФИО, группа/класс (если есть)  

Дата

Претензия

В соответствии с договором оказания платных дополнительных образовательных услуг № _ от «__» ____ 20__ г. в пункте _ договора предусмотрена скидка в размере 50 % при наличии инвалидности у одного из родителей. (Копия договора прилагается.) Тем не менее мне отказали в предоставлении указанной скидки и аргументировали это тем, что «нужно было принести документы раньше» / «скидка предоставляется только 20 % учащихся по Положению», хотя соответствующее ограничение не отражено в нашем договоре и я не был(а) уведомлен(а) об этом при заключении/возобновлении договора.

Прошу:

1. Применить к моим платежам скидку 50 % в соответствии с пунктом договора и произвести перерасчёт за период с «__» ____ 20__ г. по «__» ____ 20__ г. (или указать период/месяцы).

2. Вернуть разницу (переплату) в сумме _ рублей на реквизиты: (указать реквизиты) / зачесть сумму в счёт следующих платежей.

3. В письменной форме сообщить основания отказа (если вы откажете) с указанием конкретных нормативных документов и положений, на которые вы ссылаетесь.

Копии прилагаемых документов: договор, документ об инвалидности, квитанции об оплате, копии переписки.  

Прошу ответить письменно в срок не более 10 календарных дней с момента получения данной претензии. В случае неудовлетворительного ответа или отсутствия ответа в установленный срок я буду вынужден(а) обратиться с жалобой в органы образования, Роспотребнадзор и (в случае необходимости) в суд.

Подпись, дата