Каковы в данном случае ее и мои шансы на выигрыш в суде?

В дополнение. 

Если бы договор не содержал пункта о допустимых отличиях в цвете, и разнотон был бы существенным, то заказчица могла бы ссылаться на ст. 29 Закона РФ «О защите прав потребителей», которая дает право требовать соразмерного уменьшения цены или безвозмездного устранения недостатков. Однако, наличие пункта в договоре и акт приема-передачи существенно меняют дело.

 Ваше предложение за свой счет перепокрыть столешницу и оплатить доставку — правильный шаг. Это демонстрирует вашу готовность к сотрудничеству и устранению недостатков.

Отказ заказчицы от этого предложения, особенно после монтажа, может быть истолкован судом не в ее пользу, если будет доказано, что разнотон действительно незначителен.

В дополнение. 

Если недостатки устранимы и не делают товар непригодным к использованию, суд может склониться к тому, чтобы обязать исполнителя их устранить, а не расторгать договор и возвращать деньги.

Также, согласно п.2 статьи 475 ГК РФ регулирует права покупателя при обнаружении существенных недостатков товара. Однако, в вашем случае, недостаток  незначительный.

https://www.consultant.ru/document/cons_doc_LAW_9027/17c385541834fe9a0d0996c1da3f0df8816438d0/

Тут надо сказать, что в Договоре есть пункт что изделия могут незначительно отличаться по цвету от образчика.

 В первую очередь нужно отталкиваться от условий договора, которым определяются требования к качеству товара (работы).

На это указано в ст. 4 Закона РФ «О защите прав потребителей» в силу которой

1. Продавец (исполнитель) обязан передать потребителю товар (выполнить работу, оказать услугу), качество которого соответствует договору.

При наличии закрепленной в договоре оговорки о том, что наличие разнотона в товаре (результатах) работ — суд сочтет, что отступлений от требований к качеству допущено не было.

Тут главное, чтобы все элементы были выполнены в одной цветовой гамме, что позволит указать на наличие разницы оттенка.

Подобного рода позиция представлена и в судебной практике.

Например,  в Апелляционном определении Орловского областного суда от 21.08.2024 по делу N 33-1888/2024 (УИД 57RS0023-01-2023-003414-32) суд пришел к следующему выводу

судебная коллегия учитывает, что, как следует из пункта 10.5 договора купли-продажи мебели от <дата>, при заключении указанного договора покупатель был предупрежден и согласен, что в деталях товара из массива дерева или оклеенных шпоном допускается естественная природная неоднородность по цвету (оттенку), текстуре и пористости, а также возможное расхождение цвета (оттенка) этих деталей товара с образцом, что не противоречит нормативным требованиям и не является заводским дефектом изготовителя товара (недостатком товара). Это связано с особенностями технологии производства этих деталей и материалами, из которых они изготовлены. Принимая во внимание то, что древесина и шпон имеет много оттенков и рисунков текстуры, продавец вправе передать товар, отличающийся от выставочного образца по текстуре (рисунку) и цвету (оттенку).

Поэтому есть достаточная вероятность того, что суд учтет условия Вашего договора и также придет к выводу об отсутствии недостатков по причине расхождения тонов в различных элементах столешницы.

Каковы в данном случае ее и мои шансы на выигрыш в суде? У меня на руках подписанный ею договор и акт приема-передачи.

 это доказательства конечно.

Решение суда зависит от того, примет ли суд вашу позицию.

То есть сочтет ли он, что разница в цвете между деталями является незначительной, то суд может принять вашу сторону.

Вы вправе выразить свою позицию в возражении на иск.

Вам должны прислать копию иска.

Его  вы должны представить истцу и суду во время предварительного заседания.

Желательно указать, какие именно оттенки были применены.

Стоит рассчитывать 50/50.

Договор называется: Договор на изготовление мебели по индивидуальному проекту.
1.6 Допускаются незначительные отклонения в оттенке цвета изделия по сравнению с образцом. Допускаются присутствие шпаклевки в цвет изделия, незначительных естественных древесных дефектов на Изделии. Допустимая погрешность в размерах составляет 1-3 мм.

Значит, отступления от условий Договора и вовсе нет. 

Вы можете аргументированно отказать ей в ее просьбе.