Здравствуйте.
Зависит от того, укладывается ли фактически отработанное время в норму часов за учетный период - это ключевой момент при сменном 12-часовом графике с суммированным учетом рабочего времени (ст. 104 ТК РФ). Само по себе превышение 8-часового дня или 40-часовой недели переработкой не считается - при суммированном учете смотрят итог за месяц, квартал или год, что установлено у вас в ПВТР или коллективном договоре.
Сверхурочными признаются только те часы, которые превысили норму по производственному календарю за весь учетный период (ст. 99 ТК РФ). Вот эти часы оплачиваются по ст. 152 ТК РФ: первые два - в полуторном размере, дальше - в двойном. Если же сотрудник просто отработал смену по утвержденному графику и по итогу периода норма не превышена - это обычное рабочее время, оплачивается в одинарном размере, никаких доплат не требуется.
Отдельный нюанс с 1 сентября 2024 года: расчет полуторного и двойного размера теперь идет не с "голого" оклада, а с учетом всех надбавок и стимулирующих выплат - это прямо следует из позиции Конституционного суда (Постановление КС РФ № 35-П). Многие бухгалтерии продолжают считать только от оклада - это прямое нарушение и повод для жалобы в ГИТ.
Есть и подводный момент: если у вас переработка возникает не по итогам периода, а систематически "сверх графика" (например, вахтера просят задержаться сверх его 12-часовой смены), это уже другая история - там переработка считается сразу, посменно, а не по итогам периода.
Получите конкретный план действий по ситуации: что сделать дальше, какие документы подготовить и на какие сроки ориентироваться.